Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brpf1B2RRD7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brpf1B2RRD7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms