Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pm20d2A3KG59 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms