Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tlr1Q9EPQ1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms