Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mid1ip1Q9CQ20 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid1ip1Q9CQ20 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms