Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.6Q85ZW5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.6Q85ZW5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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