Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
9930111J21Rik1Q5SVP0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
9930111J21Rik1Q5SVP0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms