Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capza1P47753 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capza1P47753 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capza1P47753 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capza1P47753 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capza1P47753 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capza1P47753 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capza1P47753 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capza1P47753 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capza1P47753 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capza1P47753 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capza1P47753 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capza1P47753 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capza1P47753 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capza1P47753 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms