Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem200cJ3QK46 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem200cJ3QK46 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms