Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1iE9Q7P2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1iE9Q7P2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms