Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx12Q9ER00 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx12Q9ER00 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms