Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Syne1Q6ZWR6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Syne1Q6ZWR6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Syne1Q6ZWR6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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