Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5730522E02RikQ5SP45 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5730522E02RikQ5SP45 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
5730522E02RikQ5SP45 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5730522E02RikQ5SP45 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5730522E02RikQ5SP45 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5730522E02RikQ5SP45 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
5730522E02RikQ5SP45 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5730522E02RikQ5SP45 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5730522E02RikQ5SP45 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5730522E02RikQ5SP45 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
5730522E02RikQ5SP45 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5730522E02RikQ5SP45 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5730522E02RikQ5SP45 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5730522E02RikQ5SP45 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5730522E02RikQ5SP45 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5730522E02RikQ5SP45 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5730522E02RikQ5SP45 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
5730522E02RikQ5SP45 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
5730522E02RikQ5SP45 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms