Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm4491E0CX42 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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