Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hacd4A2AKM2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hacd4A2AKM2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms