Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Six6Q9QZ28 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Six6Q9QZ28 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Six6Q9QZ28 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Six6Q9QZ28 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Six6Q9QZ28 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Six6Q9QZ28 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Six6Q9QZ28 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Six6Q9QZ28 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Six6Q9QZ28 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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