Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lsm4Q9QXA5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lsm4Q9QXA5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms