Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Irx6Q9ER75 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Irx6Q9ER75 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms