Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Subh2bvQ9D9Z7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Subh2bvQ9D9Z7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms