Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gadd45gip1Q9CR59 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gadd45gip1Q9CR59 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gadd45gip1Q9CR59 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gadd45gip1Q9CR59 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gadd45gip1Q9CR59 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gadd45gip1Q9CR59 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gadd45gip1Q9CR59 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gadd45gip1Q9CR59 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gadd45gip1Q9CR59 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gadd45gip1Q9CR59 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gadd45gip1Q9CR59 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gadd45gip1Q9CR59 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gadd45gip1Q9CR59 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gadd45gip1Q9CR59 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gadd45gip1Q9CR59 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gadd45gip1Q9CR59 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gadd45gip1Q9CR59 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gadd45gip1Q9CR59 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms