Protein–RNA interactions for Protein: Q6RKD8

Flrt1, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flrt1Q6RKD8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Flrt1Q6RKD8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flrt1Q6RKD8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms