Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mre11Q61216 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Mre11Q61216 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mre11Q61216 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms