Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
WhammQ571B6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
WhammQ571B6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms