Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capza1P47753 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capza1P47753 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capza1P47753 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capza1P47753 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capza1P47753 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capza1P47753 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capza1P47753 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capza1P47753 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capza1P47753 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capza1P47753 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capza1P47753 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms