Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rom1P32958 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rom1P32958 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rom1P32958 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rom1P32958 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rom1P32958 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rom1P32958 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rom1P32958 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rom1P32958 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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