Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb9P28076 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms