Protein–RNA interactions for Protein: A2AVA0

Svep1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1A2AVA0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Svep1A2AVA0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Svep1A2AVA0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Svep1A2AVA0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Svep1A2AVA0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Svep1A2AVA0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Svep1A2AVA0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Svep1A2AVA0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Svep1A2AVA0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Svep1A2AVA0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Svep1A2AVA0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Svep1A2AVA0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Svep1A2AVA0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Svep1A2AVA0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Svep1A2AVA0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Svep1A2AVA0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Svep1A2AVA0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Svep1A2AVA0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Svep1A2AVA0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Svep1A2AVA0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Svep1A2AVA0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Svep1A2AVA0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms