Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim3Q99PE5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim3Q99PE5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms