Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
5730522E02RikQ5SP45 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5730522E02RikQ5SP45 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms