Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb9P28076 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb9P28076 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms