Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad7O35253 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad7O35253 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smad7O35253 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad7O35253 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Smad7O35253 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad7O35253 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad7O35253 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad7O35253 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad7O35253 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad7O35253 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smad7O35253 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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