Protein–RNA interactions for Protein: G3UZF1

Gm20509, Predicted gene 20509 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20509G3UZF1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20509G3UZF1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20509G3UZF1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 617 ms