Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8247F6VRJ8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8247F6VRJ8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms