Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdh18E9Q9Q6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cdh18E9Q9Q6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.8 ms