Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Edf1Q9JMG1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edf1Q9JMG1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edf1Q9JMG1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edf1Q9JMG1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edf1Q9JMG1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edf1Q9JMG1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edf1Q9JMG1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edf1Q9JMG1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edf1Q9JMG1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edf1Q9JMG1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edf1Q9JMG1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edf1Q9JMG1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms