Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hmgn5Q9JL35 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hmgn5Q9JL35 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms