Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med16Q6PGF3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med16Q6PGF3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms