Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trappc10Q3TLI0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trappc10Q3TLI0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms