Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 ISC1YER019W 1434 nt5.92□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 THI22YPR121W 1719 nt5.92□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 GRX2YDR513W 432 nt5.92□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 MAG1YER142C 891 nt5.92□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 YGR107WYGR107W 450 nt5.92□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 YHL037CYHL037C 402 nt5.92□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 CPR3YML078W 549 nt5.92□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 COX5AYNL052W 462 nt5.92□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 YNL057WYNL057W 333 nt5.92□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 MSN1YOL116W 1149 nt5.92□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 UBP16YPL072W 1500 nt5.92□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 ERG11YHR007C 1593 nt5.92□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 YDR131CYDR131C 1671 nt5.91□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 FAD1YDL045C 921 nt5.91□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 YER135CYER135C 393 nt5.91□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 CFD1YIL003W 882 nt5.91□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 YIL161WYIL161W 708 nt5.91□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 FOL3YMR113W 1284 nt5.91□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 DBF2YGR092W 1719 nt5.91□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 MEC3YLR288C 1425 nt5.91□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 CIT1YNR001C 1440 nt5.91□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 ERG7YHR072W 2196 nt5.9□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 CYC8YBR112C 2901 nt5.9□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 HXT2YMR011W 1626 nt5.9□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 RPL35BYDL136W 363 nt5.9□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 DCS1YLR270W 1053 nt5.9□□□□□ -1.46
SRF1Q12516 YTA12YMR089C 2478 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 ERG5YMR015C 1617 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 YDL152WYDL152W 366 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 YDL187CYDL187C 330 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 PRM8YGL053W 714 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 BUD13YGL174W 801 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 MCR1YKL150W 909 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 YKR041WYKR041W 753 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 RPS19BYNL302C 435 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 RMI1YPL024W 726 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 TAX4YJL083W 1815 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 ABZ1YNR033W 2364 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 APN2YBL019W 1563 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 GAS3YMR215W 1575 nt5.89□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 SKN1YGR143W 2316 nt5.88□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 MRS1YIR021W 1092 nt5.88□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 YKL177WYKL177W 339 nt5.88□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 YAR029WYAR029W 225 nt5.88□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 ATP11YNL315C 957 nt5.88□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 YPR195CYPR195C 330 nt5.88□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 TRM12YML005W 1389 nt5.88□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 DIA3YDL024C 1407 nt5.88□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 CLB1YGR108W 1416 nt5.88□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 NAM9YNL137C 1461 nt5.88□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 ALG6YOR002W 1635 nt5.88□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 MDM38YOL027C 1722 nt5.88□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 YDL163WYDL163W 303 nt5.87□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 ECL1YGR146C 636 nt5.87□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 AHP1YLR109W 531 nt5.87□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 PBI2YNL015W 228 nt5.87□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 RPA43YOR340C 981 nt5.87□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 SRB6YBR253W 366 nt5.87□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 ADF1YCL058W-A 342 nt5.87□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 CLB2YPR119W 1476 nt5.87□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 SAS10YDL153C 1833 nt5.87□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 TMN2YDR107C 2019 nt5.87□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 BUL1YMR275C 2931 nt5.86□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 TEL2YGR099W 2067 nt5.86□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 YDL109CYDL109C 1944 nt5.86□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 GEP3YOR205C 1671 nt5.86□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 NOP56YLR197W 1515 nt5.86□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 FMP30YPL103C 1407 nt5.86□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 TVP15YDR100W 432 nt5.86□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 NCB2YDR397C 441 nt5.86□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 SNZ3YFL059W 897 nt5.86□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 YGR127WYGR127W 939 nt5.86□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 SOL4YGR248W 768 nt5.86□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 MAK16YAL025C 921 nt5.86□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 PDR17YNL264C 1053 nt5.86□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 SNZ2YNL333W 897 nt5.86□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 FPK1YNR047W 2682 nt5.86□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 LYS2YBR115C 4179 nt5.85□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 EKI1YDR147W 1605 nt5.85□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 TFB2YPL122C 1542 nt5.85□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 GLN3YER040W 2193 nt5.85□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 snR5snR5 204 nt5.85□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 SPL2YHR136C 447 nt5.85□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 YLR050CYLR050C 486 nt5.85□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 CKA2YOR061W 1020 nt5.85□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt5.85□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 RAD3YER171W 2337 nt5.85□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 MAK5YBR142W 2322 nt5.85□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 THR4YCR053W 1545 nt5.84□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 HXK2YGL253W 1461 nt5.84□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 PRM1YNL279W 1986 nt5.84□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 TEF1YPR080W 1377 nt5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21 ms