Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl9P51670 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccl9P51670 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl9P51670 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms