Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Epb41P48193 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb41P48193 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb41P48193 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Epb41P48193 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epb41P48193 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb41P48193 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Epb41P48193 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb41P48193 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms