Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cnga1P29974 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnga1P29974 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cnga1P29974 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms