Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20425E9Q035 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm20425E9Q035 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm20425E9Q035 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm20425E9Q035 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm20425E9Q035 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm20425E9Q035 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm20425E9Q035 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm20425E9Q035 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm20425E9Q035 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm20425E9Q035 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm20425E9Q035 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm20425E9Q035 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm20425E9Q035 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm20425E9Q035 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm20425E9Q035 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms