Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pm20d2A3KG59 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms