Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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