Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpc1Q9QZF2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms