Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapbQ9QY76 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms