Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herpud1Q9JJK5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Herpud1Q9JJK5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms