Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smco4Q9JIS3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco4Q9JIS3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms