Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Alkbh4Q9D8F1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms