Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec22cQ8BXT9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms